Державне бюро розслідувань і президент Зеленський у 2022 році запевнили Ваганяна в проведенні справедливого розслідування, про що йшлося на засіданні тимчасової слідчої комісії.

У квітні 2022 року Державне бюро розслідувань та особисто президент Володимир Зеленський обіцяли бізнесмену Сергію Ваганяну розслідування проти тоді голови СБУ Івана Баканова та Андрія Наумова, який за словами бізнесмена фактично керував службою, однак ситуація так і не зрушила з місця. Більше того, за словами бізнесмена, йому і досі надходять погрози.

На засіданні Тимчасової слідчої комісії, що займається розслідуванням корупційних дій під час війни, Ваганян повідомив, що після його виїзду з України до Австрії у вересні 2021 року, у квітні 2022 року до нього завітали директор Державного бюро розслідувань Олексій Сухачов та керівник Управління внутрішнього контролю ДБР Богдан Чобіток. Вони провели з ним бесіду, під час якої він дав свідчення проти Наумова та Баканова стосовно систематичних хабарів. Ваганян підкреслив, що їхні свідчення були зафіксовані на аудіо, але жодних документів, що підтверджують допит, він не підписував.

При цьому Ваганян зазначив, що під час допиту верхівка ДБР розмовляли телефоном із окремими людьми: "Одне прізвище було Татаров, інше Цуцкірідзе (ерший заступник Голови Національної поліції України). Це стосувалось моєї справи".

Ваганян також поділився, що під час проведення цих слідчих заходів у нього відбулася бесіда з президентом Володимиром Зеленським. Під час цієї розмови президент висловив думку, що якщо Іван справді винен і ситуацію прояснять, то всі звинувачення будуть зняті, а конфісковане майно повернуть.

За інформацією підприємця, ініціатором бесіди з президентом виступив Сухачов, який зателефонував Зеленському і увімкнув гучний зв'язок.

"Він сказав, що розшук інтерполу мені скасують, щоб я надалі працював зі слідством, давав покази, які я даю", - уточнив Ваганян деталі тієї розмови.

При цьому бізнесмен висловив певність, що розмовляв особисто із Зеленським, оскільки "впізнав його голос".

Після цього, як зазначив Ваганян, з ним зв'язався співробітник Державного бюро розслідувань Володимир Прокопенко, а його адвокати вступили у контакт з Артемом Шевчишиним, заступником керівника головного слідчого управління Національної поліції Максима Цуцкерідзе.

"Людина, яка фальсифікувала проти мене цю кримінальну справу. Він ніяк не хотів давати матеріалів справи. І сказав, що якщо потрібно буде, то мене все рівно не пустять, а знайдуть на мене всі нові епізоди", - стверджував Ваганян.

Сергій Ваганян у середині січня висловився про наявність корупційної системи в Службі безпеки. Він стверджує, що Іван Баканов, колишній голова СБУ, разом з Андрієм Наумовим, що займав пост керівника Головного управління внутрішньої безпеки, трансформували санкції РНБО у свій особистий бізнес-проєкт.

Ваганян заявив, що сам платив гроші з прибутків від експорту зерна, за що йому гарантували "відсутність проблем із контролюючими органами". Деякі із "винагород" виглядали як подарунки у вигляді коштовних меблів, автомобілів, дорогих прикрас. Передавали, за його словами, і гроші. За словами бізнесмена, "суми коштів, які щомісячно завозив до СБУ, були мільйонами доларів. Деколи доходило й до десяти".

У той же час Національне антикорупційне бюро оголосило про відкриття кримінальної справи у зв'язку з можливим отриманням незаконних вигод колишніми керівниками Служби безпеки України.

На засіданні ТСК 9 лютого Ваганян висловив думку, що призначення Івана Баканова на пост голови Служби безпеки України сталося виключно через його близькі стосунки з президентом Володимиром Зеленським. Проте, за його словами, Баканов виявився абсолютно некомпетентним, а реальне управління СБУ здійснював Андрій Наумов. Бізнесмен стверджує, що вони разом організували схему фінансових зборів з бізнесменів, частина коштів з якої потрапляла до Офісу президента. На запитання, чи був Зеленський в курсі цих махінацій, Ваганян не зміг дати чіткої відповіді, але припустив, що президент, ймовірно, міг бути в курсі.